自主後一九六零年起一群旅居多倫多台灣人基督徒因追求共同的信仰理想，先由查經團契開始聚會，漸而組成教會並借用於Leaside長老教會禮拜堂。至一九七五年因要加入加拿大長老教會乙事有不同之看法，致分成長老教會與台語教會各自發展。於是本教會往一九七五年三月第一主日正式成立，定名為多倫多台灣基督長老教會。而在同年十二月廿六日加入加拿大長老教會。是時會員共四十一名。
成立以來全體會友就以自治、自養、 自傳之精神與目標共同努力，於是教勢日 漸成長。至一九八二年成人會員有七十九 名而儲蓄金約有五萬元，經由當時長執會 主席劉瑞仁牧師之鼓勵，也待全體會友一 致同意而聘請到當時在紐約牧會之王南傑 牧師為本會第一任牧師。由於Leaside教會 所提供的場所已不適使用，至一九八三年 四月遷移至Weston長老教會聚會，因借用 禮拜堂有諸多不便，適逢東中會出售禮拜 堂，乃以十五萬元在一九八八年十二月購 得，再以四十多萬元擴建整修，其中中會 補助二萬五千元，終於在一九九零年遷入此屬於自己的禮拜堂。
總會於一九 九三年一月指示本會按照中會之決議行事 ，九名新任長老於四月十一日產生 ，並在五月九日就職完畢，在囑託議長Dr. DonaldWade 及新任長執的領導下開始進入 另一新的里程碑。因此教會的狀況也漸漸上軌道，如提供場所給聯邦政府 資助的本地新移民社團上英文課程及托兒使用。青少年團契的各項事工很是活躍，平常聚會都在三十五名左右，使教會重得活氣。主日崇拜參加人數也在一百廿名左右。
我們於一九九三年九月聘得馬士桂牧師(Rev. Bruce Musgrave)為青年輔導牧師 ，後於一九九五年六月轉往浸信會任青年輔導牧師。在一九九四年八月卅一日江榮憫牧師全家五人從N．B．到達多倫多，同年九月十一日由加拿大基督長老教會東多倫多中會主持正式就任本會第二任牧師。2000年青年指導Mr. John Tors 離任青年指導。2001年本教會敦聘 Mr. Bob 謝 為青年指導。2002年二月二十六日江榮憫牧師因聘辭職前往美國德州。2002年4月起由總會派遣囑託議長麥煜道牧師(曾於台灣宣道)至本教會代理。2004年十月一日潘健信牧師接任本會牧師，後於2009年四月三十日離任。
現任郭毓安牧師於2011年10月在溫哥華封牧並在同年11月20日就任為主任牧師，負起繼續牧養教會的事工。
我們經過這一段艱苦建堂的日子和試鍊，幸蒙主施恩與憐憫，相信一切都有祂美好的旨意，為要使愛祂的人得益處。主說:「我的殿必稱為萬國禱告的殿，又有說:”若不是耶和華建造房屋，建造的人枉然努力．…．”，如何成為神忠心的管家是我們這一群從新得力之奴僕所當努力的功課，也是我們對每位兄姊所期待的禱告。